Biodonostia OIIko Koldo Garcia Etxebarria Genetika Gastrointestinaleko arduradunak eta Luis Bujanda Gaixotasun Hepatikoen eta Gastrointestinalen Arloko arduradunak, hurrenez hurren, ikerketa bat koordinatu dute. Ikerketa horrek, lehen aldiz, genomaren, mikrobiomaren eta metabolomaren arteko elkarreraginak ikertzen ditu gizakiengan.
Kolon eta ondesteko minbizia da eragin handiena duen minbizi motetako bat, eta heriotza eragiten duen bigarren kausa herrialde garatuetan. Aurreko azterlan batean, gorozkietan dauden bakterioen (mikrobioma) eta gorozkietan dauden metabolitoen (metaboloma) arteko erlazioak ezarri ziren, baita adenomak eta kolon eta ondesteko minbizia garatzeko arriskuan duten zeregina ere. Lan berri honetan genoma sartu da, aldaera genetikoen multzoa, geruza biologiko horiek gaixotasun horiek garatzeko arriskuan inplikatuta dauden prozesuak nola baldintzatzen dituzten hobeto ulertzeko.
Alde batetik, aldaera genetikoek aurretik lortutako emaitzetan izan dezaketen eragina aztertu zen. Horrela, ikusi zen adenomaren eta kolon eta ondesteko minbiziaren arriskuarekin lotutako bakterio batzuen eta metabolito batzuen presentziak aldaera genetikoen eragina zutela, eta aldaera horiek, era berean, aurretik kolon eta ondesteko minbiziaren garapenarekin lotutako geneetan kokatuta zeudela (besteak beste, LINC01605, PROKR2 eta CCSER1 geneetan). Gainera, egindako analisiek erakutsi zuten genomak kolesterol-mailei eragiten diela (kolon-ondesteko minbizian ezagutzen den arrisku-faktorea) hainbat mekanismo biologikoren bidez.
Bestalde, genoma, mikrobioma eta metabolomaren artean egon zitezkeen interakzio guztiak aldi berean aztertu ziren. Azterketa horretatik ondorioztatu zen geruza biologiko bakoitzetik lortzen den informazioa osagarria dela; izan ere, interakzioak puntualak dira, aldez aurretik azaldutakoak bezalakoak, orokortuak baino gehiago. Hau da, geruza biologiko bakoitzak adenoma eta kolon eta ondesteko minbizia garatzeko arriskuaren zati bat azaltzen du eta, beraz, geruza biologiko desberdinen azterketa integrala beharrezkoa da gaixotasun horiek hobeto ulertzeko.
Azkenik, hainbat eredu sortu ziren adenomak eta kolon eta ondesteko minbizia garatzeko arriskua aurreikusteko. Iragartzeko gaitasun handiena zuen eredua izan zen aldaera genetiko informatiboenei buruzko informazioa txertatu zuena bakterioen eta metabolitoen generoetan, aurrez iragartzeko gaitasun handia erakutsi baitzuten.
Lan honen egileek espero dute lortutako emaitzek bide berriak irekitzea adenomaren eta kolon eta ondesteko minbiziaren garapenean inplikatutako mekanismo biologikoak hobeto ulertzeko eta, horrela, gaixotasun horiek tratatzeko diana terapeutikoak eta arrisku-markatzaileak proposatzeko.
Ikerketa hau Galizia Hegoaldea Osasun Ikerketarako Institutuko (Ourense) eta CIC Bioguneko ikertzaileekin batera egin da, gibeleko eta digestio gaixotasunen CIBEReko (CIBEREHD) kideak; eta Cancers aldizkarian argitaratu da.
Artikulua:
Garcia-Etxebarria et al. 2021. Interplay between Genome, Metabolome and Microbiome in Colorectal Cancer. Cancers: 13(24), 6216; https://doi.org/10.3390/cancers13246216.
