Arnas Infekzioa eta Mikrobio kontrako Erresistentzia

Responsable de Grupo: Jose María Marimón Ortiz De Zárate Dk.

Donostialdea ESI josemaria.marimonortizdez@osakidetza.eus
José María Marimón Ortiz De Zárate doktorea Farmazian lizentziatu zen Santiago de Compostelako Unibertsitatean (1989) eta Mikrobiologian doktorea da Universidad del País Vasco/Euskal Herriko Unibertsitatean (UPV/EHU) (2000). Mikrobiologian eta Parasitologia Klinikoan espezialista da FIR bidez (1992-1995). 1997tik Donostia Unibertsitate Ospitaleko (Donostialdea ESI) Mikrobiologia Zerbitzuko mediku ondokoa da. Biologia Molekularra eta Automatizazioa Saileko burua da 2013tik.
82 lan baino gehiago argitaratu ditu Estatuko eta nazioarteko aldizkarietan, liburuko kapitulu baten egilea da eta 3 doktorego-tesi zuzendu ditu. Lehiaketa-deialdietan 20 proiektu nazional edo nazioarteko eman dizkiote, nazioarteko patente bat du eta proba diagnostiko bat du merkaturatuta.
2011tik UPV/EHUko Medikuntza Fakultateko Medikuntza Prebentiboa eta Osasun Publikoa Saileko masterreko irakaslea da. CIBERes – Arnas Gaixotasunen Sareko Ikerketa Biomedikoko Zentroko 26. taldeko laguntzailea da 2006tik eta bertako burua 2017 eta 2018 artean. SEIMCeko Zuzendaritza Batzordeko kidea izan zen 2012 eta 2015 artean.
Marimón doktorea Biodonostia OIIko Gaixotasun Infekziosoen Arloko Arnas Infekzioa eta Mikrobio Kontrako Erresistentzia ikerketa-taldeko liderra da 2017tik.
.

Helburu estrategikoak

• Arnas infekzioa:

Streptococcus pneumoniae bakterioak eragindako infekzioa.

Infección por Streptococcus pneumoniae.

  • Infekzio neumokoziko inbaditzailea haurrengan eta helduengan: agerpena, serotipoak eta genotipoak.
  • Infekzio neumokoziko ez-inbaditzailea: otitisa eta konjuntibitisa. Serotipoak eta genotipoak. Erresistentzia antibiotikoa.
  • Txerto-azterketak. Txerto konjugatu 13-balentearen inpaktua. Txerto 7-balentearekin konparazioa. Haurren txertaketaren eragina txerto 13-balente berriarekin, infekzio. inbaditzailean eta eramate nasofaringeoan, bizitzako lehen urteetan.
  • Neumokokoa tipifikatzeko teknika berriak diseinatzea.
  • Biofilm pneumokozikoaren funtzioa arnas infekzio kronikoetan (BGBK).

Streptococcus pyogenes bakterioak eragindako infekzioa

  • Gaixotasun ez-inbaditzailea eragiten duten anduien eragina eta karakterizazioa: S. pyogenes bakterioagatiko otitisa eta baginitisa.
  • S. pyogenes bakterioagatiko pneumonia. Alderdi kliniko-epidemiologikoak.
  • Faringitisa eragiten duten isolatuen karakterizazio fenotipikoa eta genotipiko. Suszeptibilitate antibiotikoaren azterketa.

Birusak eragindako arnas infekzioa.

  • Gripearen birusak eragindako infekzioak. Andui urtarotarren karakterizazio genetikoa.
  • Gripe-sindromea eragiten duten birusen epidemiologia, gripearen birusa kanpo. Bakoitzaren urtarokotasuna, ospitaleratze-tasa eta eragindako biztanleriaren gehienezko adina.
  • Birus-infekzioen balioa BGBKren berriro gaizkiagotzean.
  • Arnas birus indartu berrien ezaugarri mikrobiologikoak: H1N1 birus pandemikoaren eta H3N2 txerri-birusaren gripea, giza metapneumobirusa, bokabirusa. Eragiten dituzten infekzioen diagnostikoa eta epidemiologia..
  • Bi arnas birusek edo gehiagok eragindako infekzio mistoen edo birusen eta bakterioen artean ( pneumoniaren kasuan, adibidez) eragindakoen ezaugarriak

Biriketako gaixotasun buxatzaile kronikoa (BGBK).

  • Infekzio eta berrinfekzio berrien balioa BGBKren larriagotzean.
  • Bakterioen edo birusen eraginaren iraupena arnas traktuan BGBK duten pazienteengan.
  • Tratamendu antibiotikoak eta antibiralak larriagotzearen aurrean duen zeregina.

Tuberkulosia.

  • Tuberkulosiaren azterketa epidemiologikoa Gipuzkoan.
  • Teknika molekularrak erabiltzea tuberkulosiaren aurkako erresistentziaren diagnostikoan eta azterketan; horretarako, lagin klinikoen gainean zuzenean lan egiten da..
  • Suszeptibilitate antibiotikoko teknika fenotipikoen eta genotipikoen konparazioa Mycobacterium tuberculosis bakterioen anduietan.
  • M. tuberculosis: spoligotyping eta MIRU-VNTR isolatuen karakterizazio molekularra.

Erresistentzia bakterianoa:

Helburu nagusia: mikrobio-kontrako erresistentziaren epidemiologia eta horren ardura duten mekanismoak (agerpena eta hedapena).

Erresistentzia bakterianoa Gram bakterio positiboetan.

  • Streptococcus pneumoniae bakterioaren erresistentzia antibiotikoak denboran duen bilakaera ezagutzea: infekzioa eragiten duten serotipo berriak eta horien erresistentzia-determinatzaile genetikoak; biztanleriak oro har egiten duen antibiotikoen kontsumoak erresistentzian duen eragina; klon multierresistenteen sakabanatzea txerto konjugatuak sartu ondoren.
  • 2010ean txerto konjugatu 13-balentea merkaturatzearen ondorioz, “serotipo erresistenteak” ordezkatu direla baieztatzea. Haurren txertaketaren eragina erresistentzia antibiotikoan.
  • Streptococcus pyogenes bakterioak antibiotiko makrolidoen, tetraziklinen eta fluorokinolonen aurrean dituen erresistentzia-mekanismoak ezartzeas.

Ahotik hartzeko antiseptikoen bidezko profilaxiaren efektua ZIUn irensteagatiko pneumoniak prebenitzeko. Prebalentzia eta mikroorganismo erresistenteak hautatzeko gaitasuna.

  • Desinfektatzaileen aurkako erresistentzia eta beste mikrobio-kontrako batzuekin lotutako erresistentzia ezagutzea Zaintza Intentsiboko Unitateetan (ZIU).
  • Antiseptikoekiko erresistentzia-indukzioa in vitro. Erresistentziarekin erlazionatutako gene eta mutazioen karakterizazioa.
  • Isolatu erresistenteen karakterizazio fenotipikoa eta genotipikoa. Egokitzapen fenotipikoaren edo erresistentzia egonkorraren fenomenoa eta biofilma osatzeko gaitasuna zehaztea. Profil metabolitikoen konparazioa andui sentikorren eta erresistenteen artean..

Erresistentzia bakterianoa beste mikroorganismo batzuetan.

  • Mikrobio-kontrako erresistentziaren prebalentzia mikrobiota komentsalean eta patogeno gastroenterikoetan. Erresistentzien erantzule diren mekanismo molekularrak.
  • Mikrobio-kontrako erresistentzia detektatzea animalien edo giza pazienteen patogeno zoonotiko isolatuetan (adib.: metalo beta-laktamasak).
  • Ospitale-jatorriko erresistentziak bakterioetan. Erresistentzia-mekanismo berriak dituzten beste bakterio multierresistente batzuk ikertzea: karbapenemasa berriak, betalaktamasa konstitutiboak eta plasmidikak.

Ikerketa-ildo nagusiak

  • Arnas infekzioa:
    • Streptococcus pneumoniae bakterioak eragindako infekzioa.
    • Streptococcus pyogenes bakterioak eragindako infekzioa.
    • Hain ohikoak ez diren birusek eta eragileek (Nocardia eta Coxiella) eragindako arnas infekzioa.
  • Mikrobio-kontrako erresistentzia:
    • Erresistentzia bakterianoa arnas patogenoetan.
    • Erresistentzia bakterianoa gastroenteritisa eragiten duten patogeno zoonotikoetan.
    • Erresistentzia bakterianoa. Hainbat mikroorganismo.

Taldekideak

Izena-abizenak
Zentroa Emaila
Marta Alonso Asencor OSI Donostialdea marta.alonsoasencor@osakidetza.eus
Maitane Aranzamendi Zaldunbide OSI Donostialdea maitane.aranzamendizaldumbide@osakidetza.eus
María Ercibengoa Arana Biodonostia OII maria.ercibengoaarana@osakidetza.eus
Pedro Idigoras Viedma OSI Donostialdea pedromaria.idigorasviedma@osakidetza.eus
Diego Vicente Anza OSI Donostialdea diego.vicenteanza@osakidetza.eus
Loreto Vidaur Tello OSI Donostialdea loreto.vidaurtello@osakidetza.eus

Ekoizpen Zientifikoa

EPIDEMIOLOGIA MOLECULAR DE LA TUBERCULOSIS EN LA COMUNIDAD AUTONOMA DEL PAIS VASCO. DIVERSIDAD DE LAS CEPAS AUTOCTONAS E IMPORTADAS. ESTUDIO GENETICO DE LA RESISTENCIA ANTIBIÓTICA
Código: 2016111036
Investigador Principal (IP): DIEGO VICENTE ANZA
Entidad Financiadora: DEPARTAMENTO DE SALUD
Fecha de Inicio: 2016-12-01
Fecha de finalización: 2020-12-31
Importe Concedido: 38.950,00 €
ESTUDIO DE LA ALTERACION DEL MICROBIOMA RESPIRATORIO EN PACIENTES CON NEUMONIA GRAVE ADQUIRIDA EN LA COMUNIDAD Y SU RELACION CON LOS BIOMARCADORES DE INFLAMACION
Código: PI17/01463
Investigador Principal (IP): JOSE MARIA MARIMON ORTIZ DE ZARATE
Entidad Financiadora: ISCIII INSTITUTO DE SALUD CARLOS III
Fecha de Inicio: 2018-01-01
Fecha de finalización: 2023-06-30
Importe Concedido: 93.170,00 €
RED COLABORATIVA MULTIDISCIPLINAR PARA LA VIGILANCIA DE BACTERIAS CON RESISTENCIA ANTIBIOTICA EN LA CAPV
Código: 2019111038
Investigador Principal (IP): JOSE MARIA MARIMON ORTIZ DE ZARATE
Entidad Financiadora: DEPARTAMENTO DE SALUD
Fecha de Inicio: 2020-10-22
Fecha de finalización: 2023-10-21
Importe Concedido: 69.358,00 €
CORONA-TEST DETECCION ESPECIFICA DE CORONAVIRUS UTILIZANDO UNA TECNOLOGÍA PROPIETARIA DE SOMAPROBES MEDIANTE SONDAS DE OLIGONUCLEOTIDOS
Código: FBG20/002
Investigador Principal (IP): JOSE MARIA MARIMON ORTIZ DE ZARATE
Entidad Financiadora: FUNDACION BIOZIENTZIAK GIPUZKOA FUNDAZIOA
Fecha de Inicio: 2020-04-01
Fecha de finalización: 2020-12-31
Importe Concedido: 0,00 €
BIOCHIP-DESARROLLO DE MICROARRAYS DE ANTICUERPOS Y ANTIGENOS COMO PLATAFORMA PARA EL DIAGNOSTICO Y ESTUDIO EPIDEMIOLOGICO DE COVID-19
Código: SPRICOVID20/008
Investigador Principal (IP): JOSE MARIA MARIMON ORTIZ DE ZARATE
Entidad Financiadora: DEPARTAMENTO DE DESARROLLO ECONOMICO, SOSTENIBILIDAD Y MEDIO AMBIENTE
Fecha de Inicio: 2020-04-01
Fecha de finalización: 2020-12-31
Importe Concedido: 17.565,88 €