Responsable de Grupo: Dr. Jose María Marimón Ortiz De Zárate

OSI Donostialdea josemaria.marimonortizdez@osakidetza.eus

Objetivos Estratégicos

Infección respiratoria:
Objetivo principal: estudio de la epidemiología de la infección respiratoria.

Infección por Streptococcus pneumoniae.

• Infección neumocócica invasiva pediátrica y en adultos: incidencia, serotipos y genotipos.
• Infección neumocócica no invasiva: otitis y conjuntivitis. Serotipos y genotipos. Resistencia antibiótica.
• Estudios vacunales. Impacto de la vacuna conjugada 13-valente. Comparación con la vacuna 7-valente. Influencia de la vacunación infantil con la nueva vacuna 13-valente en la infección invasora y en la portación naso-faríngea en los primeros años de vida.
• Diseño de nuevas técnicas de tipificación de neumococo.
• El papel del biofilm neumocócico en las infecciones respiratorias crónicas (EPOC).

Infección por Streptococcus pyogenes.

• Incidencia y caracterización de cepas causantes de enfermedad no invasora: otitis y vaginitis por S. pyogenes.
• Neumonía por S. pyogenes. Aspectos clínico-epidemiológicos.
• Caracterización fenotípica y genotípica de los aislados causantes de faringitis. Estudio de la susceptibilidad antibiótica.

Infección respiratoria causada por virus.

• Infecciones por influenza-virus. Caracterización genética de las cepas estacionales.
• Epidemiología de los virus causantes de síndrome gripal diferentes del virus de la gripe. Estacionalidad, hospitalización y edades de máxima incidencia de cada uno de ellos.
• Valor de las infecciones virales en la reagudización de la EPOC.
• Características microbiológicas de virus respiratorios emergentes: influenza virus pandémico H1N1 y porcino H3N2, metapneumovirus humano, bocavirus. Diagnóstico y epidemiología de sus infecciones.
• Características de las infecciones mixtas por dos o más virus respiratorios o entre virus y bacterias en casos de neumonía.

Enfermedad pulmonar obstructiva crónica (EPOC).

• Valor de las nuevas infecciones y reinfecciones en la exacerbación de la EPOC.
• Persistencia bacteriana o viral en el tracto respiratorio de pacientes con EPOC.
• Papel del tratamiento antibiótico y antiviral en la exacerbación.

Tuberculosis.

• Estudio epidemiológico de la tuberculosis en Gipuzkoa.
• Aplicación de técnicas moleculares al diagnóstico y al estudio de la resistencia antituberculosa realizado directamente sobre muestras clínicas.
• Comparación de las técnicas fenotípicas y genotípicas de susceptibilidad antibiótica en cepas de Mycobacterium tuberculosis.
• Caracterización molecular de los aislados de M. tuberculosis: spoligotyping y MIRU-VNTR.

Resistencia bacteriana:

Objetivo principal: epidemiología de la resistencia antimicrobiana y los mecanismos (presencia y difusión) responsables de los mismos.

Resistencia bacteriana en bacterias Gram positivas.

• Determinar la evolución de la resistencia antibiótica de Streptococcus pneumoniae en el tiempo: nuevos serotipos causantes de infección y sus determinantes genéticos de resistencia; influencia del consumo antibiótico en la población general en la resistencia; diseminación de clones multiresistentes tras la incorporación de las vacunas conjugadas.
• Constatar el reemplazamiento de los “serotipos resistentes” como consecuencia de la comercialización de la vacuna conjugada 13-valente en 2010. Influencia de la vacunación infantil en la resistencia antibiótica.
• Establecer los mecanismos de resistencia de Streptococcus pyogenes a los antibióticos macrólidos, tetraciclinas, y fluoroquinolonas.

Efecto de la profilaxis con antisépticos orales en UVI para prevenir neumonías de aspiración. Prevalencia y capacidad de selección de microorganismos resistentes.

• Conocer la prevalencia de la resistencia a desinfectantes y resistencias asociadas a otros antimicrobianos en Unidades de Vigilancia Intensiva (UVI).
• Inducción de resistencia a antisépticos in vitro. Caracterización de los genes y mutaciones asociadas a la resistencia.
• Caracterización fenotípica y genotípica de los aislados resistentes. Determinar los fenómenos de adaptación fenotípica o resistencia estable y capacidad de formación de biofilm. Comparación de los perfiles metabólicos entre cepas sensibles y resistentes.

Resistencia bacteriana en otros microorganismos.

• Prevalencia de la resistencia antimicrobiana en microbiota comensal y en patógenos gastroentéricos zoonóticos. Mecanismos moleculares responsables de las resistencias.
• Caracterización de patógenos bacterianos comunitarios y de las bacterias multiresistentes incluidas en el PRAN mediante secuenciación de genoma completo (WGS).
• Resistencia en bacterias de origen hospitalario. Investigación de otras bacterias multiresistentes con mecanismos de resistencia nuevos: nuevas carbapenemasas, betalactamasas constitutivas y plasmidicas.

Principales líneas de investigación

• Infección Respiratoria:
  • Infección por Streptococcus pneumoniae.
  • Infección por Streptococcus pyogenes.
  • Infección respiratoria causada por virus y agentes menos usuales (Nocardia y Coxiella).
• Resistencia Antimicrobiana:
  • Resistencia bacteriana en patógenos respiratorios.
  • Resistencia bacteriana en patógenos zoonóticos causantes de gastroenteritis.
  • Resistencia bacteriana. Otros microorganismos.