Infección Respiratoria y Resistencia Antimicrobiana

Responsable de Grupo: Dr. Jose María Marimón Ortiz De Zárate

OSI Donostialdea josemaria.marimonortizdez@osakidetza.eus
El Dr. José María Marimón Ortiz De Zárate es Licenciado en Farmacia por la Universidad de Santiago de Compostela (1989) y Doctor en Microbiología por la Universidad del País Vasco/Euskal Herriko Unibertsitatea (UPV/EHU) (2000). Especialista en Microbiología y Parasitología Clínica vía FIR (1992-1995). Desde 1997 Facultativo Adjunto del Servicio de Microbiología del Hospital Universitario Donostia (OSI Donostialdea). Jefe de Sección de Biología Molecular y Automatización desde 2013.
Autor de más de 82 publicaciones en revistas tanto nacionales como internacionales, 1 capítulo de libro y 3 Tesis Doctorales dirigidas. Más de 20 proyectos nacionales e internacionales competitivos concedidos, una patente internacional y una prueba diagnóstica comercializada.
Desde 2011, es docente del Máster del Departamento de Medicina Preventiva y Salud Pública de la Facultad de Medicina de la UPV/EHU. Colaborador del grupo 26 del CIBERes (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Respiratorias) desde junio de 2006 y Jefe del mismo durante 2017 y 2018. Vocal de la Junta Directiva de la SEIMC entre 2012 y 2015.
El Dr. Marimón es Responsable del Grupo de Infección Respiratoria y Resistencia Antimicrobiana del Área de Enfermedades Infecciosas del IIS Biodonostia desde 2017.

Objetivos Estratégicos

Infección respiratoria:
Objetivo principal: estudio de la epidemiología de la infección respiratoria.

Infección por Streptococcus pneumoniae.

  • Infección neumocócica invasiva pediátrica y en adultos: incidencia, serotipos y genotipos.
  • Infección neumocócica no invasiva: otitis y conjuntivitis. Serotipos y genotipos. Resistencia antibiótica.
  • Estudios vacunales. Impacto de la vacuna conjugada 13-valente. Comparación con la vacuna 7-valente. Influencia de la vacunación infantil con la nueva vacuna 13-valente en la infección invasora y en la portación naso-faríngea en los primeros años de vida.
  • Diseño de nuevas técnicas de tipificación de neumococo.
  • El papel del biofilm neumocócico en las infecciones respiratorias crónicas (EPOC).

Infección por Streptococcus pyogenes.

  • Incidencia y caracterización de cepas causantes de enfermedad no invasora: otitis y vaginitis por S. pyogenes.
  • Neumonía por S. pyogenes. Aspectos clínico-epidemiológicos.
  • Caracterización fenotípica y genotípica de los aislados causantes de faringitis. Estudio de la susceptibilidad antibiótica.

Infección respiratoria causada por virus.

  • Infecciones por influenza-virus. Caracterización genética de las cepas estacionales.
  • Epidemiología de los virus causantes de síndrome gripal diferentes del virus de la gripe. Estacionalidad, hospitalización y edades de máxima incidencia de cada uno de ellos.
  • Valor de las infecciones virales en la reagudización de la EPOC.
  • Características microbiológicas de virus respiratorios emergentes: influenza virus pandémico H1N1 y porcino H3N2, metapneumovirus humano, bocavirus. Diagnóstico y epidemiología de sus infecciones.
  • Características de las infecciones mixtas por dos o más virus respiratorios o entre virus y bacterias en casos de neumonía.

Enfermedad pulmonar obstructiva crónica (EPOC).

  • Valor de las nuevas infecciones y reinfecciones en la exacerbación de la EPOC.
  • Persistencia bacteriana o viral en el tracto respiratorio de pacientes con EPOC.
  • Papel del tratamiento antibiótico y antiviral en la exacerbación.

Tuberculosis.

  • Estudio epidemiológico de la tuberculosis en Gipuzkoa.
  • Aplicación de técnicas moleculares al diagnóstico y al estudio de la resistencia antituberculosa realizado directamente sobre muestras clínicas.
  • Comparación de las técnicas fenotípicas y genotípicas de susceptibilidad antibiótica en cepas de Mycobacterium tuberculosis.
  • Caracterización molecular de los aislados de M. tuberculosis: spoligotyping y MIRU-VNTR.

Resistencia bacteriana:

Objetivo principal: epidemiología de la resistencia antimicrobiana y los mecanismos (presencia y difusión) responsables de los mismos.

Resistencia bacteriana en bacterias Gram positivas.

  • Determinar la evolución de la resistencia antibiótica de Streptococcus pneumoniae en el tiempo: nuevos serotipos causantes de infección y sus determinantes genéticos de resistencia; influencia del consumo antibiótico en la población general en la resistencia; diseminación de clones multiresistentes tras la incorporación de las vacunas conjugadas.
  • Constatar el reemplazamiento de los “serotipos resistentes” como consecuencia de la comercialización de la vacuna conjugada 13-valente en 2010. Influencia de la vacunación infantil en la resistencia antibiótica.
  • Establecer los mecanismos de resistencia de Streptococcus pyogenes a los antibióticos macrólidos, tetraciclinas, y fluoroquinolonas.

Efecto de la profilaxis con antisépticos orales en UVI para prevenir neumonías de aspiración. Prevalencia y capacidad de selección de microorganismos resistentes.

  • Conocer la prevalencia de la resistencia a desinfectantes y resistencias asociadas a otros antimicrobianos en Unidades de Vigilancia Intensiva (UVI).
  • Inducción de resistencia a antisépticos in vitro. Caracterización de los genes y mutaciones asociadas a la resistencia.
  • Caracterización fenotípica y genotípica de los aislados resistentes. Determinar los fenómenos de adaptación fenotípica o resistencia estable y capacidad de formación de biofilm. Comparación de los perfiles metabólicos entre cepas sensibles y resistentes.

Resistencia bacteriana en otros microorganismos.

  • Prevalencia de la resistencia antimicrobiana en microbiota comensal y en patógenos gastroentéricos. Mecanismos moleculares responsables de las resistencias.
  • Detectar resistencia antimicrobiana en patógenos zoonoticos aislados de animales o de pacientes humanos (ej. metalo beta-lactamasas).
  • Resistencia en bacterias de origen hospitalario. Investigación de otras bacterias multiresistentes con mecanismos de resistencia nuevos: nuevas carbapenemasas, betalactamasas constitutivas y plasmidicas.

Principales líneas de investigación

  • Infección Respiratoria:
    • Infección por Streptococcus pneumoniae.
    • Infección por Streptococcus pyogenes.
    • Infección respiratoria causada por virus y agentes menos usuales (Nocardia y Coxiella).
  • Resistencia Antimicrobiana:
    • Resistencia bacteriana en patógenos respiratorios.
    • Resistencia bacteriana en patógenos zoonóticos causantes de gastroenteritis.
    • Resistencia bacteriana. Otros microorganismos.

Miembros del equipo

Nombre Apellidos
Centro E-mail
Marta Alonso Asencor OSI Donostialdea marta.alonsoasencor@osakidetza.eus
Maitane Aranzamendi Zaldunbide OSI Donostialdea maitane.aranzamendizaldumbide@osakidetza.eus
María Ercibengoa Arana IIS Biodonostia maria.ercibengoaarana@osakidetza.eus
Pedro Idigoras Viedma OSI Donostialdea pedromaria.idigorasviedma@osakidetza.eus
Diego Vicente Anza OSI Donostialdea diego.vicenteanza@osakidetza.eus
Loreto Vidaur Tello OSI Donostialdea loreto.vidaurtello@osakidetza.eus

Producción Científica

EPIDEMIOLOGIA MOLECULAR DE LA TUBERCULOSIS EN LA COMUNIDAD AUTONOMA DEL PAIS VASCO. DIVERSIDAD DE LAS CEPAS AUTOCTONAS E IMPORTADAS. ESTUDIO GENETICO DE LA RESISTENCIA ANTIBIÓTICA
Código: 2016111036
Investigador Principal (IP): DIEGO VICENTE ANZA
Entidad Financiadora: DEPARTAMENTO DE SALUD
Fecha de Inicio: 2016-12-01
Fecha de finalización: 2020-12-31
Importe Concedido: 38.950,00 €
ESTUDIO DE LA ALTERACION DEL MICROBIOMA RESPIRATORIO EN PACIENTES CON NEUMONIA GRAVE ADQUIRIDA EN LA COMUNIDAD Y SU RELACION CON LOS BIOMARCADORES DE INFLAMACION
Código: PI17/01463
Investigador Principal (IP): JOSE MARIA MARIMON ORTIZ DE ZARATE
Entidad Financiadora: ISCIII INSTITUTO DE SALUD CARLOS III
Fecha de Inicio: 2018-01-01
Fecha de finalización: 2023-06-30
Importe Concedido: 93.170,00 €
RED COLABORATIVA MULTIDISCIPLINAR PARA LA VIGILANCIA DE BACTERIAS CON RESISTENCIA ANTIBIOTICA EN LA CAPV
Código: 2019111038
Investigador Principal (IP): JOSE MARIA MARIMON ORTIZ DE ZARATE
Entidad Financiadora: DEPARTAMENTO DE SALUD
Fecha de Inicio: 2020-10-22
Fecha de finalización: 2023-10-21
Importe Concedido: 69.358,00 €
CORONA-TEST DETECCION ESPECIFICA DE CORONAVIRUS UTILIZANDO UNA TECNOLOGÍA PROPIETARIA DE SOMAPROBES MEDIANTE SONDAS DE OLIGONUCLEOTIDOS
Código: FBG20/002
Investigador Principal (IP): JOSE MARIA MARIMON ORTIZ DE ZARATE
Entidad Financiadora: FUNDACION BIOZIENTZIAK GIPUZKOA FUNDAZIOA
Fecha de Inicio: 2020-04-01
Fecha de finalización: 2020-12-31
Importe Concedido: 0,00 €
BIOCHIP-DESARROLLO DE MICROARRAYS DE ANTICUERPOS Y ANTIGENOS COMO PLATAFORMA PARA EL DIAGNOSTICO Y ESTUDIO EPIDEMIOLOGICO DE COVID-19
Código: SPRICOVID20/008
Investigador Principal (IP): JOSE MARIA MARIMON ORTIZ DE ZARATE
Entidad Financiadora: DEPARTAMENTO DE DESARROLLO ECONOMICO, SOSTENIBILIDAD Y MEDIO AMBIENTE
Fecha de Inicio: 2020-04-01
Fecha de finalización: 2020-12-31
Importe Concedido: 17.565,88 €