Author Archives: Biodonostia

Publicado un artículo de consenso internacional sobre cáncer biliar

Investigadores del Grupo de Enfermedades Hepáticas del IIS Biodonostia junto con otros investigadores del CIBERehd (CIBER en su área temática de Enfermedades Hepáticas y Digestivas del ISCIII) han participado en la elaboración de un artículo de consenso internacional sobre aspectos multidisciplinares del cáncer biliar (colangiocarcinoma).

Este documento proporciona información valiosa sobre epidemiología, factores de riesgo, clasificaciones, características patológicas, células de origen, modificaciones genéticas y epigenéticas, mecanismos de quimiorresistencia así como tratamientos actuales disponibles para este tipo de cáncer. En el documento se indican, además, los retos futuros en investigación básica y clínica.

En la realización de este artículo, publicado el 30 de Junio en la prestigiosa revista Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology, han participado los investigadores, Jesús Bañales, Pedro Rodrigues y Matxus Perugorría (IIS Biodonostia-OSI Donostialdea) junto con investigadores de otros centros de referencia, IBSAL/Univ Salamanca (José J.G. Marín y Rocío IR Macías) y Hospital Clinic (Jordi Bruix y Alejandro Forner) y cuenta con el apoyo de la European Network for the Study of Cholangiocarcinoma (ENS-CCA), una red de investigación colaborativa multidisciplinar sobre colangiocarcinoma de referencia internacional.

Artículo de referencia:
Cholangiocarcinoma 2020: the next horizon in mechanisms and management.
Banales JM, Marin JJG, Lamarca A, Rodrigues PM, Khan SA, Roberts LR, Cardinale V, Carpino G, Andersen JB, Braconi C, Calvisi DF, Perugorria MJ, Fabris L, Boulter L, Macias RIR, Gaudio E, Alvaro D, Gradilone SA, Strazzabosco M, Marzioni M, Coulouarn C, Fouassier L, Raggi C, Invernizzi P, Mertens JC, Moncsek A, Rizvi S, Heimbach J, Koerkamp BG, Bruix J, Forner A, Bridgewater J, Valle JW, Gores GJ. Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 2020 Jun 30. doi: 10.1038/s41575-020-0310-z. PMID: 32606456

Las características genéticas ayudarían a identificar personas más vulnerables al desarrollo de formas graves de COVID-19

Investigadores del Área de Enfermedades Hepáticas y Gastrointestinales del Instituto de Investigación Biodonostia- OSI Donostialdea liderados por Luis Bujanda (Investigador CIBERehd, UPV/EHU y médico especialista en Digestivo de la OSI Donostialdea) y Jesús Bañales (Investigador Ikerbasque, Miguel Servet y CIBERehd), han participado en un estudio colaborativo internacional en el que se describe, por primera vez, que la vulnerabilidad de ciertas personas al desarrollo de formas clínicas graves en la infección por el virus SARS-COV-2 puede estar influenciada por sus características genéticas.

Los investigadores han intentado responder a la pregunta de por qué algunas personas son asintomáticas o presentan cuadros leves mientras otras desarrollan cuadros de gravedad al ser infectadas por el virus SARS-COV-2. Según explican los directores de los grupos participantes, “hemos buscando la respuesta en los genes y hemos encontrado una fuerte asociación entre ciertas variantes genéticas en los cromosomas 3 y 9 y la gravedad de la enfermedad causada por el coronavirus”.

En este estudio internacional han participado científicos de diferentes hospitales y centros del estado (Euskadi, Cataluña, Madrid y Andalucía) y de Lombardía (epicentro de la pandemia en Italia), y ha contado con la coordinación nacional de Jesús Bañales y la internacional de genetistas de Noruega y Alemania.

Tras la aprobación del proyecto por los comités éticos de las instituciones españolas e italianas participantes, se recogieron muestras de sangre de 1.610 pacientes con COVID-19 que necesitaban apoyo respiratorio (oxigeno o ventilación mecánica); de ellas 338 fueron recogidas en el Hospital Univesitario Donostia a través del Laboratoriao de Bioquímica por Adolfo Garrido y Beatriz Nafría, y con el apoyo técnico y logístico de Laura Izquierdo y el Dr. Pedro Rodrigues (Biodonostia). Se extrajo ADN de las muestras de sangre para estudiar en el laboratorio de Kiel (Alemania) cerca de 9 millones de variantes genéticas. Para ello se contó con expertos genetistas y bioinformáticos, entre ellos el Dr. Garcia-Etxebarria (responsable del Grupo de Genética Gastrointestinal del IIS Biodonostia) y el Dr. D’Amato (Investigador Ikerbasque y colaborador del mismo grupo), así como con la rápida donación económica de filántropos noruegos. Los variantes de los pacientes infectados por COVID fueron comparados por 2.205 controles sanos, 950 de ellos del Grupo de Genética Gastrointestinal del IIS Biodonostia obtenidos a través del Biobanco Vasco y analizadas por medio de fondos económicos aportados por los grupos del Dr Bujanda, Dr Bañales y Dr D’Amato.

Este trabajo, que acaba de publicarse en la prestigiosa revista científica New England Journal of Medicine, indica que variantes de dos regiones del genoma humano se asocian con un mayor riesgo de desarrollar fallo respiratorio en pacientes con infección por SARS-COV-2. Una de ellas se localiza en el cromosoma 3 y puede afectar a la expresión de genes que favorecerían la entrada del virus, así como la generación de la “tormenta de citoquinas”. La segunda región se localiza en el cromosoma 9, en concreto en el gen que determina el grupo sanguíneo del sistema ABO. En este sentido, los datos mostraron que tener el grupo sanguíneo A se asocia con un 50% más de riesgo de necesidad de apoyo respiratorio en caso de infección por el coronavirus. Por el contrario, poseer el grupo sanguíneo O confiere un efecto protector frente al desarrollo de insuficiencia respiratoria (35% menos de riesgo).

Merece la pena resaltar también que la variante genética identificada en el cromosoma 3 era más frecuente en personas más jóvenes (media de 59 años), lo que podría explicar, al menos en parte, la gravedad de ciertos casos en este grupo de edad.

En el estudio se observó la asociación significativa de las variantes genéticas localizadas en los cromosomas 3 y 9 con la necesidad de apoyo respiratorio. Así, la frecuencia de ambas variantes genéticas en los cromosomas 3 y 9 es significativamente mayor en los pacientes que necesitaron ventilación mecánica frente a aquellos en los que únicamente se administró oxígeno, asociación que fue independiente de la edad y sexo de los pacientes. Por lo tanto, la presencia de estas variantes genéticas predispone al desarrollo de formas graves de insuficiencia respiratoria durante la infección por SARS-COV-2.

 

Un paso más en la identificación de población de riesgo de COVID-19

Investigaciones previas habían indicado que factores como la edad y enfermedades crónicas como la diabetes e hipertensión, así como la obesidad, aumentan el riesgo a desarrollar casos graves de COVID-19. Sin embargo, este estudio demuestra la posibilidad de identificar personas más vulnerables al desarrollo de enfermedad grave con insuficiencia pulmonar por el coronovirus según sus características genéticas, lo que posibilita identificar grupos de riesgo que necesiten una protección especial y diseñar tratamientos personalizados.

Este estudio europeo colaborativo ha sido el primero en identificar factores genéticos que aumentan el riesgo de desarrollar insuficiencia respiratoria en pacientes con COVID-19. Sin embargo, no es el único estudio que está investigando en esta línea, existiendo diferentes consorcios internacionales cuyo objetivo es identificar características genéticas de riesgo de COVID-19. Así, futuros estudios permitirán ahondar en estos resultados.

Enlace al artículo de referencia:                
Genome-wide association study in severe Covid-19 with respiratory failure. David Ellinghaus, Ph.D., Frauke Degenhardt, M.Sc., Luis Bujanda, M.D., Ph.D., Maria Buti, M.D., Ph.D., Agustín Albillos, M.D., Ph.D., Pietro Invernizzi, M.D., Ph.D., Javier Fernández, M.D., Ph.D., Daniele Prati, M.D., Guido Baselli, Ph.D., Rosanna Asselta, Ph.D., Marit M. Grimsrud, M.D., Chiara Milani, Ph.D., et al., for The Severe Covid-19 GWAS Group*. New England Journal of Medicine 2020. DOI: 10.1056/NEJMoa2020283

Corte de la entrevista realizada en EITB-Teleberri el 18-06-2020:

Fomento de San Sebastián y Biodonostia trasladan a Turín su experiencia y colaboración en el desarrollo del ámbito biosanitario de San Sebastián

La ciudad Turín ha escogido la experiencia de Donostia y el modelo colaborativo entre Biodonostia y Fomento de San Sebastián, como referente de cara a su proyecto de desarrollo como polo de biosalud.

Desde la Comisión europea, en el marco de proyecto ECORIS3 que lidera fomento de San Sebastián, se ha aprobado un proyecto piloto que permitirá trasladar a la ciudad italiana el modelo desplegado por Biodonostia como Instituto de Innovación Sanitaria, y la propia colaboración con Fomento en los ámbitos de la transferencia tecnológica a empresas, el apoyo al emprendimiento y generación de start ups o la propia socialización del conocimiento.

En los próximos meses representantes de ambas entidades viajarán a Turín para presentar las claves del desarrollo del ecosistema de salud de Donostia y su modelo de colaboración. El concejal de Impulso Económico, Enrique Ramos, apuntó que “este paso demuestra que la apuesta de la ciudad por las políticas de promoción y desarrollo de la ciencia y la innovación comienzan a tener repercusión fuera de nuestras fronteras. También contemplamos una monitorización del desarrollo del modelo en Turín durante la primera fase del proyecto piloto”.

Tras visitar y conocer el ecosistema donostiarra, y la labor desplegada por Biodonostia y Fomento de San Sebastián, la organización Cittá Metropolitana di Torino decidió poner en marcha su propio ecosistema en el ámbito de salud y biosalud en la zona metropolitana de Turín, con un modelo similar al desarrollado en Donostia, especialmente con el fomento del ámbito digital en el sector de salud desde la colaboración de los sectores públicos y privados.

Una de las herramientas con las que trabajan Biodonostia y Fomento de San Sebastián que expondrán en Turín, son los bonos tecnológicos, una fórmula de subvención de proyectos con componente tecnológico promovidos por empresas y personas emprendedoras locales a través de servicios especializados, estudios y apoyos técnicos que Biodonostia aporta en los procesos de desarrollo de productos o servicios tecnológicos.

El origen de esta iniciativa se enmarca en el proyecto europeo INTERREG ECORIS 3 que lidera Fomento, en el marco del impulso europeo por fomentar políticas y medidas para apoyar los ecosistemas de innovación locales y regionales.

 

La startup Indicate Solutions participa en el programa Headstart del Instituto Europeo de Innovación y Tecnología en Salud

Indicate Solutions es una de las 16 startups españolas que ha sido seleccionada para participar en Headstart, el programa del Instituto Europeo de Innovación y Tecnología en Salud (EIT Health) que ofrece acompañamiento y financiación de hasta 50,000 euros para que compañías emergentes desarrollen sus innovaciones.

Las innovaciones, seleccionadas de entre las 69 solicitudes presentadas, corresponden a cuatro categorías: Dispositivos médicos (Medtech), biotecnología (Biotech) salud digital (Digital Health) y soluciones contra COVID-19.

Indicate Solutions desarrolla un dispositivo de diagnóstico de sangre rápido, barato y fiable para el diagnóstico de cáncer y enfermedades infecciosas, en un formato similar a la prueba de embarazo, que se puede usar cuándo y dónde sea necesario. La solución tiene como objetivo permitir a los médicos tomar decisiones rápidas de tratamiento y mejorar la vida de los pacientes.

Indicate Solutions tiene su origen en un proyecto multidisciplinar liderado por el Dr. Charles Lawrie, Responsable del Área de Oncología del IIS Biodonostia, (además de CEO interino de Indicate Solutions), y en el que participan también CIC BiomaGUNE, Polymat, DIPC y Ceit-IK4.

Las empresas españolas forman parte del total de 89 proyectos que ha seleccionado EIT Health en toda Europa, y que persigue acelerar el desarrollo y el tiempo de comercialización de los productos y servicios innovadores por ellas desarrollados, para mejorar la vida de los pacientes y ciudadanos europeos.

Más información:

https://eithealth.eu/news-article/eit-health-announces-start-ups-selected-for-2020-headstart-programme/

https://www.elreferente.es/sociales/16-startups-espanolas-seleccionadas-para-el-programa-headstart-de-eit-health-35169

UPV/EHU, Biodonostia and Ikerbasque researchers develop new drugs for treating polycystic hepatorenal diseases

Polycystic hepatorenal diseases are hereditary, genetic disorders characterised by the progressive development of multiple symptomatic cysts in the kidneys and/or liver which may cause alterations in the function of these organs and/or complications associated with their growth. Right now, there are no effective pharmacological treatments and the only curative option is organ transplant.

Researchers at the University of the Basque Country (UPV/EHU) led by Dr Fernando Cossío, scientific director of Ikerbasque, and in the Liver Diseases Group at the Biodonostia Institute of Health Research, led by the Ikerbasque research fellow Dr Jesús M. Bañales, have collaborated on the development of new drugs that have proven to be effective in reducing the growth of hepatic and renal cysts in experimental models of this disease, which could be of huge clinical significance. Researchers at the University of Salamanca, led by Dr José J. G. Marín, at the Idibell Institute of Catalonia, led by Dr Manel Esteller, and at the Hormel Institute of Minnesota (USA), headed by Dr Sergio Gradilone, have collaborated in this multidisciplinary project led by the two Basque institutions.

The drugs developed are based on the structure of ursodeoxycholic acid (UDCA), a bile acid present in the body at a low concentration and which has protective properties for the liver. In fact, its administration is recommended for treating specific liver diseases. The researchers based themselves on the structure and properties of this molecule to design and synthesise a family of chemical derivatives geared towards inhibiting a key protein responsible for encouraging the growth of hepatorenal cysts. The results published have shown that these new drugs are capable of blocking the growth of hepatic and renal cysts in an animal model of this disease.

The promising therapeutic effects of these new drugs have managed to spark great interest in the international scientific community. So much so that the work was selected to be presented orally at the International Congress of the EASL, the European Association for the Study of the Liver, held in Vienna. It has also been published recently in the prestigious international journal Hepatology (official journal of the American Association for the Study of Liver Diseases), and has given rise to the PhD thesis by Dr Francisco J. Caballero (UPV/EHU, Biodonostia), lead author of the said work, supervised by Dr Fernando Cossío (UPV/EHU) and Dr Jesús M. Bañales (Biodonostia, Ikerbasque).

This project recently received the FIPSE national award for Innovation (Ministry of Science and Innovation) which enabled a patent for these drugs to be taken out; they have been licensed to the company ATLAS Molecular Pharma of the Basque Country so that their clinical study can be pursued. This project has also had competitive funding from the RIS3 Euskadi Programme, Ministry of Science and Innovation, the Carlos III Institute of Health (ISCIII) and Ikerbasque.

Reference article:
Caballero‐Camino, F.J., Rivilla, I., Herraez, E., Briz, O., Santos‐Laso, A., Izquierdo‐Sanchez, L., Lee‐Law, P.Y., Rodrigues, P.M., Munoz‐Garrido, P., Jin, S., Peixoto, E., Richard, S., Gradilone, S.A., Perugorria, M.J., Esteller, M., Bujanda, L., Marin, J.J., Banales, J.M. and Cossio, F.P. (2020), New synthetic conjugates of ursodeoxycholic acid inhibit cystogenesis in experimental models of polycystic liver disease. Hepatology. Accepted Author Manuscript. doi:10.1002/hep.31216

Watch EITB video report (2020/05/2):

Biodonostia consigue la capacitación para realizar PCR para el diagnóstico de COVID-19

El Instituto de Investigación Sanitaria Biodonostia (IIS Biodonostia) forma parte desde ayer  del grupo de centros que han logrado la capacitación del Instituto de Salud CarlosIII (ISCIII), referente del Ministerio de Ciencia y Tecnología, para, mediante la realización de pruebas de reacción en cadena de la polimerasa, PCR, ayudar en el diagnóstico de COVID-19

La realización de pruebas de PCR para colaborar en el cribado de la población que pueda haber estado en contacto con el coronavirus SARS CoV2, causante del covid-19, requiere la acreditación, de los centros de investigación, tanto públicos como privados. Es decir, es necesario el cumplimiento de determinados estándares en materia de personal y medios técnicos.

Desde el primer momento de la crisis sanitaria, el IIS Biodonostia ha puesto todo su potencial humano y técnico al servicio de la labor asistencial. Desde esta disposición de colaboración, Biodonostia, coordinado por el Servicio de Microbiología del Hospital Donostia, forma parte del plan de contingencia diseñado por Osakidetza ante una necesidad de testado mediante PCR de la presencia del virus SARS-Cov2.

Una vez más la I+D de Osakidetza va de la mano de la asistencia clínica.

Cerca de la mitad de las innovaciones de la sanidad pública vasca están en proceso de salir al mercado

El ecosistema de organizaciones públicas sanitarias de Euskadi tiene activos en estos momentos medio centenar de innovaciones, desde métodos y dispositivos de diagnóstico de melanomas hasta aplicaciones para el impulso de hábitos de vida saludables. Todo el sistema -en el que se encuentran Osakidetza, los institutos de investigación sanitaria Bioaraba, Biodonostia y Biocruces-Bizkaia, y Kronikgune, junto con BIOEF (Fundación vasca de Innovación e Investigación Sanitarias)–cuenta a principios de 2020 con una cartera tecnológica activa de 46 desarrollos. De todos ellos, cerca de la mitad, el 44%, está ya en manos de empresas y otras entidades externas a través de acuerdos de explotación con los que se están ejecutando procesos de valorización, certificación e industrialización previos necesarios para que estas soluciones en el ámbito de la biosalud lleguen a la práctica clínica y al mercado.  

Son solo algunos datos que reflejan la transferencia del conocimiento que aglutinan día a día  profesionales de la salud y de la investigación biosanitaria de la red pública de Euskadi. El importante volumen de ideas y conocimiento muy pegados a las necesidades de los y las pacientes en su día a día se transforma por medio de procesos de intraemprendimiento e investigación en transferencias que pueden multiplicar sus efectos para la mejora de la calidad de vida de las personas. El 35% de la cartera está implementada en la práctica clínica de Osakidetza.  

Este conocimiento se ha producido en muchas ocasiones en colaboración con otros agentes de la Red Vasca de Ciencia, Tecnología e Innovación (casi la mitad), y genera oportunidades de negocio en las empresas del entorno. Del total de desarrollos que cuentan con un acuerdo de licencia de explotación, el 60% son vascas, contribuyendo así al desarrollo socioeconómico de Euskadi. 

De los 46 desarrollos, el 48% son tecnológicos: nueve iniciativas de materiales y dispositivos, otras nueve relacionadas con la biotecnología y el diagnóstico molecular, y cuatro vinculadas a los medicamentos. El resto de desarrollos se centra sobre todo (46%, 21 desarrollos) en la implantación de las TIC en el entorno sanitario y el 6% restante, tres casos, están relacionados con la innovación organizativa.  

15 familias de patentes activas 

En estos momentos, el sistema sanitario público de Euskadi cuenta con una cartera de 15 familias de patentes activas, 12 de ellas internacionales y tres de ellas nacionales. Asimismo, hay dos modelos de utilidad, ocho registros de marca que responden a seis desarrollos, cinco inventos protegidos como secreto industrial ‘know how’ y 18 desarrollos, muchos de ellos en el ámbito de las TIC, bajo el amparo de derechos de propiedad intelectual.  

Entre los desarrollos, se encuentran desde soluciones TIC, softwares y ‘serious games’ que van a ser integrados en Osakidetza para programas de salud como la deshabituación tabáquica o tratamientos de la obesidad juvenil, hasta biomarcadores para la identificación, por ejemplo, del riesgo de padecer un accidente cerebrovascular o métodos para el diagnóstico y pronóstico de melanoma. También existen dispositivos médicos para el tratamiento de la apnea de sueño postural o la identificación del paciente frágil, así como desarrollos de nuevas estrategias terapéuticas con el diseño de moléculas para el tratamiento de la enfermedad hepática poliquística o el estudio de nuevos usos de medicamentos ya conocidos.  

Osakidetza, a través de sus institutos de investigación sanitaria, participa en más de 60 proyectos o ensayos clínicos para hacer frente al coronavirus

Osakidetza, a través de sus institutos de investigación sanitaria –Bioaraba, Biocruces-Bizkaia, Biodonostia y Kronikgune- participa en torno a 60 proyectos o estudios de investigación clínica para hacer frente al COVID-19. Los proyectos se centran principalmente en el tratamiento de la neumonía generada por el coronavirus, en el estudio epidemiológico del virus, el diagnóstico precoz, o en el impacto socio-económico de esta enfermedad.

Entre los proyectos que están en fase de desarrollo, cabe destacar cinco por el grado de colaboración tanto de los propios institutos como con otros agentes de la Red Vasca de Ciencia, Tecnología e Innovación y empresas:

Detección de coronavirus utilizando sonda de oligonucleótidos en muestras clínicas de pacientes sintomáticos y asintomáticosConsiste en la prueba rápida, segura y económica para detectar la enfermedad. Un proyecto que se está realizando a través de los tres institutos de investigación, en colaboración con la empresa promotora, y cuyo mecanismo de detección sería similar al de los test de embarazo.

Ensayo clínico multicéntrico ‘Solidarity‘. Está promovido por la OMS y su objetivo es conocer los efectos que tienen cuatro tratamientos antivirales en la mortalidad hospitalaria, así como en la duración de la estancia del paciente en el hospital. En este proyecto participan los principales centros sanitarios de Euskadi a través de los institutos de investigación.

Diseño y evaluación preclínica de subdominios de ACE2 como antivirales contra SARS-COV-2. Se centra es el desarrollo de nuevas moléculas que puedan ser utilizadas como antivirales para el tratamiento de la enfermedad mediante diseño computacional. Se trata de un proyecto liderado por el Instituto de Investigación Sanitaria Biodonostia junto con el CIC-nanoGUNE, con la colaboración de otras instituciones como la UPV, el Donostia International Physics Center o el CSIC.

Eficacia de la infusión de plasma de donante convaleciente de infección por SARS CoV 2. Analiza la eficacia de la infusión de plasma de personas que han pasado la enfermedad en el tratamiento de la neumonía originada por este virus. Ver su eficacia permitirá contar con otra herramienta terapéutica y reducir el número de casos de neumonía grave que precisen tratamiento en la UCI. Este proyecto se está desarrollando en la OSI Barrualde-Galdakao.

Modelización Avanzada en Tiempo Real de la Evolución Epidemiológica y el Ingreso Hospitalario debido a CoVid19. Trata de predecir la evolución de la enfermedad por grupos de edad, así como los ingresos hospitalarios y la necesidad de cuidados intensivos. Estas predicciones permitirán planificar y gestionar adecuadamente la utilización de recursos de Atención Primaria, recursos hospitalarios y de cuidados críticos. Este proyecto está liderado por Kronikgune.

La Consejera de Salud, Nekane Murga, ha agradecido el esfuerzo que están realizando las y los investigadores de la red de institutos de investigación sanitaria del Servicio Vasco de Salud, coordinados por BIOEF, que trabajan “de la mano” y “poniendo al servicio de la población su conocimiento” para poder responder eficazmente a esta pandemia.

Relación de alumnos seleccionados para las prácticas de verano de 2020 en el IIS Biodonostia

Se hace pública la relación de alumnos aceptados para la realización de las Prácticas de Verano de 2020 en el Instituto de Investigación Sanitaria Biodonostia:

  • Madalen Arribas Galarreta
  • Sara Cruces Salguero
  • Irene Pi Martín
  • Aroa Elortza Payros
  • Irune Lasa Elosegi
  • Amaia Alday Izagirre

El tutor asignado responsable de las prácticas se pondrá en contacto con cada uno de los alumnos a la mayor brevedad para formalizar las prácticas y acordar las fechas.

Nota: La realización de las prácticas quedará sujeta a las condiciones que se establezcan debidas al Coronavirus.